Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 NAA60-214ENST00000572584 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms