Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SH3BP4Q9P0V3 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SH3BP4Q9P0V3 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SH3BP4Q9P0V3 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SH3BP4Q9P0V3 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SH3BP4Q9P0V3 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SH3BP4Q9P0V3 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SH3BP4Q9P0V3 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SH3BP4Q9P0V3 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SH3BP4Q9P0V3 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SH3BP4Q9P0V3 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SH3BP4Q9P0V3 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SH3BP4Q9P0V3 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SH3BP4Q9P0V3 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SH3BP4Q9P0V3 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SH3BP4Q9P0V3 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SH3BP4Q9P0V3 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SH3BP4Q9P0V3 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SH3BP4Q9P0V3 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SH3BP4Q9P0V3 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SH3BP4Q9P0V3 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SH3BP4Q9P0V3 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SH3BP4Q9P0V3 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SH3BP4Q9P0V3 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SH3BP4Q9P0V3 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SH3BP4Q9P0V3 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SH3BP4Q9P0V3 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SH3BP4Q9P0V3 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SH3BP4Q9P0V3 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SH3BP4Q9P0V3 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SH3BP4Q9P0V3 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SH3BP4Q9P0V3 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms