Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms