Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP61

ARFGAP3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGAP3Q9NP61 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
ARFGAP3Q9NP61 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ARFGAP3Q9NP61 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARFGAP3Q9NP61 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARFGAP3Q9NP61 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARFGAP3Q9NP61 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARFGAP3Q9NP61 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARFGAP3Q9NP61 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARFGAP3Q9NP61 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARFGAP3Q9NP61 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARFGAP3Q9NP61 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARFGAP3Q9NP61 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARFGAP3Q9NP61 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARFGAP3Q9NP61 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARFGAP3Q9NP61 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARFGAP3Q9NP61 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARFGAP3Q9NP61 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARFGAP3Q9NP61 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARFGAP3Q9NP61 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARFGAP3Q9NP61 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARFGAP3Q9NP61 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ARFGAP3Q9NP61 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARFGAP3Q9NP61 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARFGAP3Q9NP61 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARFGAP3Q9NP61 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARFGAP3Q9NP61 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARFGAP3Q9NP61 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ARFGAP3Q9NP61 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARFGAP3Q9NP61 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARFGAP3Q9NP61 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARFGAP3Q9NP61 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARFGAP3Q9NP61 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARFGAP3Q9NP61 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ARFGAP3Q9NP61 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARFGAP3Q9NP61 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARFGAP3Q9NP61 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARFGAP3Q9NP61 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARFGAP3Q9NP61 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARFGAP3Q9NP61 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARFGAP3Q9NP61 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARFGAP3Q9NP61 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARFGAP3Q9NP61 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARFGAP3Q9NP61 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARFGAP3Q9NP61 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARFGAP3Q9NP61 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARFGAP3Q9NP61 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ARFGAP3Q9NP61 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARFGAP3Q9NP61 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ARFGAP3Q9NP61 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ARFGAP3Q9NP61 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARFGAP3Q9NP61 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARFGAP3Q9NP61 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARFGAP3Q9NP61 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARFGAP3Q9NP61 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARFGAP3Q9NP61 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARFGAP3Q9NP61 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARFGAP3Q9NP61 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARFGAP3Q9NP61 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARFGAP3Q9NP61 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARFGAP3Q9NP61 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.3 ms