Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H6

KLHL4, Kelch-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL4Q9C0H6 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL4Q9C0H6 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL4Q9C0H6 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL4Q9C0H6 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL4Q9C0H6 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL4Q9C0H6 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL4Q9C0H6 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL4Q9C0H6 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL4Q9C0H6 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL4Q9C0H6 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL4Q9C0H6 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL4Q9C0H6 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL4Q9C0H6 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL4Q9C0H6 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL4Q9C0H6 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL4Q9C0H6 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL4Q9C0H6 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL4Q9C0H6 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL4Q9C0H6 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL4Q9C0H6 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL4Q9C0H6 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.08■□□□□ 0
KLHL4Q9C0H6 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.08■□□□□ 0
KLHL4Q9C0H6 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL4Q9C0H6 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL4Q9C0H6 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL4Q9C0H6 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL4Q9C0H6 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL4Q9C0H6 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL4Q9C0H6 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL4Q9C0H6 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL4Q9C0H6 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL4Q9C0H6 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL4Q9C0H6 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL4Q9C0H6 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL4Q9C0H6 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL4Q9C0H6 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL4Q9C0H6 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL4Q9C0H6 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.08■□□□□ 0
KLHL4Q9C0H6 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL4Q9C0H6 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.07■□□□□ 0
KLHL4Q9C0H6 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL4Q9C0H6 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL4Q9C0H6 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL4Q9C0H6 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL4Q9C0H6 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL4Q9C0H6 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL4Q9C0H6 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL4Q9C0H6 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL4Q9C0H6 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL4Q9C0H6 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL4Q9C0H6 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL4Q9C0H6 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL4Q9C0H6 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL4Q9C0H6 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL4Q9C0H6 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL4Q9C0H6 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL4Q9C0H6 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL4Q9C0H6 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL4Q9C0H6 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL4Q9C0H6 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL4Q9C0H6 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL4Q9C0H6 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL4Q9C0H6 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL4Q9C0H6 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.07■□□□□ 0
KLHL4Q9C0H6 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL4Q9C0H6 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL4Q9C0H6 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL4Q9C0H6 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms