Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZS1

FOXP3, Forkhead box protein P3, humanhuman

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Length 431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXP3Q9BZS1 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FOXP3Q9BZS1 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
FOXP3Q9BZS1 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FOXP3Q9BZS1 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
FOXP3Q9BZS1 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
FOXP3Q9BZS1 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
FOXP3Q9BZS1 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FOXP3Q9BZS1 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FOXP3Q9BZS1 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
FOXP3Q9BZS1 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
FOXP3Q9BZS1 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FOXP3Q9BZS1 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXP3Q9BZS1 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXP3Q9BZS1 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXP3Q9BZS1 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXP3Q9BZS1 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXP3Q9BZS1 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXP3Q9BZS1 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXP3Q9BZS1 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXP3Q9BZS1 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXP3Q9BZS1 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXP3Q9BZS1 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXP3Q9BZS1 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXP3Q9BZS1 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXP3Q9BZS1 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXP3Q9BZS1 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXP3Q9BZS1 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXP3Q9BZS1 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXP3Q9BZS1 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXP3Q9BZS1 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXP3Q9BZS1 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXP3Q9BZS1 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXP3Q9BZS1 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXP3Q9BZS1 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXP3Q9BZS1 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXP3Q9BZS1 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXP3Q9BZS1 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXP3Q9BZS1 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXP3Q9BZS1 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXP3Q9BZS1 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXP3Q9BZS1 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXP3Q9BZS1 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXP3Q9BZS1 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXP3Q9BZS1 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXP3Q9BZS1 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXP3Q9BZS1 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXP3Q9BZS1 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXP3Q9BZS1 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXP3Q9BZS1 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXP3Q9BZS1 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXP3Q9BZS1 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXP3Q9BZS1 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXP3Q9BZS1 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXP3Q9BZS1 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXP3Q9BZS1 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXP3Q9BZS1 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXP3Q9BZS1 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXP3Q9BZS1 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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FOXP3Q9BZS1 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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FOXP3Q9BZS1 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXP3Q9BZS1 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXP3Q9BZS1 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
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FOXP3Q9BZS1 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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FOXP3Q9BZS1 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXP3Q9BZS1 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXP3Q9BZS1 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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FOXP3Q9BZS1 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXP3Q9BZS1 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXP3Q9BZS1 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXP3Q9BZS1 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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FOXP3Q9BZS1 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXP3Q9BZS1 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXP3Q9BZS1 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXP3Q9BZS1 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXP3Q9BZS1 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXP3Q9BZS1 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXP3Q9BZS1 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXP3Q9BZS1 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXP3Q9BZS1 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXP3Q9BZS1 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXP3Q9BZS1 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXP3Q9BZS1 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXP3Q9BZS1 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXP3Q9BZS1 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXP3Q9BZS1 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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