Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 60 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 HIPK3-202ENST00000379016 7345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 ADCYAP1R1-201ENST00000304166 6487 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 LMBR1-201ENST00000353442 7997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 SLC35D1-201ENST00000235345 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 MEGF8-201ENST00000251268 9549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 KIAA0513-202ENST00000538274 7381 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 RAPH1-213ENST00000630330 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 ABI2-201ENST00000261016 6634 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 ABI2-203ENST00000261018 6638 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 GRM1-204ENST00000492807 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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SMIM3Q9BZL3 ANKH-201ENST00000284268 8203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 BTRC-203ENST00000393441 6084 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 WDR66-201ENST00000288912 4467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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SMIM3Q9BZL3 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
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SMIM3Q9BZL3 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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SMIM3Q9BZL3 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC12.76□□□□□ -0.37
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SMIM3Q9BZL3 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 PFAS-201ENST00000314666 5371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 CX3CL1-204ENST00000565912 5796 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 WAPL-201ENST00000263070 5987 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 RALGAPA1-201ENST00000307138 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMIM3Q9BZL3 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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