Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 KCNJ9-201ENST00000368088 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 LPP-AS2-201ENST00000605573 2852 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 LIMCH1-213ENST00000511496 3439 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 PTGR2-205ENST00000555661 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 SGK1-220ENST00000524929 2594 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 RTN3-210ENST00000540798 3124 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 POLG-202ENST00000442287 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 KLK2-202ENST00000358049 2847 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 CICP18-201ENST00000406017 2812 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 SLC6A5-202ENST00000525748 7084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 ENG-201ENST00000344849 3059 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 SPOCK3-203ENST00000421836 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 PIK3R1-213ENST00000521657 3891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 PLEKHB2-202ENST00000403716 4349 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 DDO-201ENST00000368923 1953 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 CIPC-201ENST00000361786 4486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 SLC6A9-205ENST00000372310 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 MAP7D2-201ENST00000379643 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 ABI2-213ENST00000424558 2240 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 SCNN1B-202ENST00000343070 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 WBP1L-202ENST00000448841 4085 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 DUOXA1-205ENST00000558422 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 PIWIL1-201ENST00000245255 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 DLGAP3-202ENST00000373347 3856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 ABCB7-203ENST00000373394 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 PPP2R1A-205ENST00000462990 2730 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 STAT3-203ENST00000404395 2633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 PCDHGB3-201ENST00000576222 4727 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 RXRG-204ENST00000619224 2252 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 AL162431.2-201ENST00000358073 2424 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC11.07□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 ARHGAP33-204ENST00000378944 4219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 G2E3-202ENST00000438909 2334 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 DHX30-206ENST00000446256 3660 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 SETD1B-202ENST00000542440 8185 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 CTCFL-208ENST00000432255 2955 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC11.07□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 BEND6-202ENST00000370746 2379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 H1FX-AS1-201ENST00000383461 2600 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 SFPQ-201ENST00000357214 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 175.2 ms