Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VN1R3Q9BXE9 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 134.6 ms