Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWC9

CCDC106, Coiled-coil domain-containing protein 106, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC106Q9BWC9 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC106Q9BWC9 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC106Q9BWC9 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC106Q9BWC9 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC106Q9BWC9 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC106Q9BWC9 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC106Q9BWC9 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC106Q9BWC9 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC106Q9BWC9 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC106Q9BWC9 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC106Q9BWC9 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC106Q9BWC9 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC106Q9BWC9 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC106Q9BWC9 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC106Q9BWC9 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC106Q9BWC9 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC106Q9BWC9 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC106Q9BWC9 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC106Q9BWC9 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC106Q9BWC9 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC106Q9BWC9 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC106Q9BWC9 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC106Q9BWC9 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC106Q9BWC9 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC106Q9BWC9 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC106Q9BWC9 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC106Q9BWC9 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC106Q9BWC9 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC106Q9BWC9 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC106Q9BWC9 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC106Q9BWC9 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC106Q9BWC9 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC106Q9BWC9 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC106Q9BWC9 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC106Q9BWC9 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC106Q9BWC9 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC106Q9BWC9 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC106Q9BWC9 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC106Q9BWC9 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC106Q9BWC9 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC106Q9BWC9 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC106Q9BWC9 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC106Q9BWC9 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC106Q9BWC9 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC106Q9BWC9 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC106Q9BWC9 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC106Q9BWC9 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC106Q9BWC9 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC106Q9BWC9 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC106Q9BWC9 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC106Q9BWC9 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC106Q9BWC9 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC106Q9BWC9 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC106Q9BWC9 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCDC106Q9BWC9 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCDC106Q9BWC9 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCDC106Q9BWC9 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCDC106Q9BWC9 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCDC106Q9BWC9 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCDC106Q9BWC9 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCDC106Q9BWC9 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC106Q9BWC9 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC106Q9BWC9 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC106Q9BWC9 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC106Q9BWC9 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC106Q9BWC9 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC106Q9BWC9 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC106Q9BWC9 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CCDC106Q9BWC9 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC106Q9BWC9 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC106Q9BWC9 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC106Q9BWC9 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC106Q9BWC9 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC106Q9BWC9 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC106Q9BWC9 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC106Q9BWC9 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC106Q9BWC9 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC106Q9BWC9 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC106Q9BWC9 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC106Q9BWC9 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC106Q9BWC9 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CCDC106Q9BWC9 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC106Q9BWC9 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC106Q9BWC9 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC106Q9BWC9 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC106Q9BWC9 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC106Q9BWC9 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC106Q9BWC9 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC106Q9BWC9 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC106Q9BWC9 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC106Q9BWC9 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC106Q9BWC9 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC106Q9BWC9 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC106Q9BWC9 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC106Q9BWC9 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC106Q9BWC9 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC106Q9BWC9 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC106Q9BWC9 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC106Q9BWC9 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC106Q9BWC9 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms