Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC17■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC17■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC17■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC17■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms