Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSL1

UBAC1, Ubiquitin-associated domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 405 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBAC1Q9BSL1 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBAC1Q9BSL1 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBAC1Q9BSL1 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBAC1Q9BSL1 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBAC1Q9BSL1 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBAC1Q9BSL1 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBAC1Q9BSL1 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBAC1Q9BSL1 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBAC1Q9BSL1 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBAC1Q9BSL1 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBAC1Q9BSL1 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
UBAC1Q9BSL1 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBAC1Q9BSL1 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBAC1Q9BSL1 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBAC1Q9BSL1 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBAC1Q9BSL1 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBAC1Q9BSL1 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBAC1Q9BSL1 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBAC1Q9BSL1 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
UBAC1Q9BSL1 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBAC1Q9BSL1 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBAC1Q9BSL1 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
UBAC1Q9BSL1 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
UBAC1Q9BSL1 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBAC1Q9BSL1 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBAC1Q9BSL1 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBAC1Q9BSL1 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBAC1Q9BSL1 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
UBAC1Q9BSL1 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBAC1Q9BSL1 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
UBAC1Q9BSL1 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBAC1Q9BSL1 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBAC1Q9BSL1 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBAC1Q9BSL1 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBAC1Q9BSL1 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBAC1Q9BSL1 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBAC1Q9BSL1 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBAC1Q9BSL1 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBAC1Q9BSL1 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBAC1Q9BSL1 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBAC1Q9BSL1 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBAC1Q9BSL1 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBAC1Q9BSL1 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBAC1Q9BSL1 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBAC1Q9BSL1 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBAC1Q9BSL1 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBAC1Q9BSL1 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBAC1Q9BSL1 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBAC1Q9BSL1 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBAC1Q9BSL1 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBAC1Q9BSL1 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBAC1Q9BSL1 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBAC1Q9BSL1 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBAC1Q9BSL1 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBAC1Q9BSL1 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBAC1Q9BSL1 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBAC1Q9BSL1 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBAC1Q9BSL1 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBAC1Q9BSL1 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBAC1Q9BSL1 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBAC1Q9BSL1 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBAC1Q9BSL1 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBAC1Q9BSL1 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBAC1Q9BSL1 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBAC1Q9BSL1 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBAC1Q9BSL1 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBAC1Q9BSL1 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBAC1Q9BSL1 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
UBAC1Q9BSL1 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBAC1Q9BSL1 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBAC1Q9BSL1 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
UBAC1Q9BSL1 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBAC1Q9BSL1 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBAC1Q9BSL1 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBAC1Q9BSL1 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBAC1Q9BSL1 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBAC1Q9BSL1 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBAC1Q9BSL1 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBAC1Q9BSL1 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBAC1Q9BSL1 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBAC1Q9BSL1 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBAC1Q9BSL1 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBAC1Q9BSL1 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBAC1Q9BSL1 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBAC1Q9BSL1 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBAC1Q9BSL1 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBAC1Q9BSL1 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBAC1Q9BSL1 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
UBAC1Q9BSL1 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
UBAC1Q9BSL1 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
UBAC1Q9BSL1 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC18.21■□□□□ 0.5
UBAC1Q9BSL1 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBAC1Q9BSL1 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
UBAC1Q9BSL1 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBAC1Q9BSL1 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBAC1Q9BSL1 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBAC1Q9BSL1 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBAC1Q9BSL1 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBAC1Q9BSL1 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBAC1Q9BSL1 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms