Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPW4

APOL4, Apolipoprotein L4, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL4Q9BPW4 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
APOL4Q9BPW4 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
APOL4Q9BPW4 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
APOL4Q9BPW4 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
APOL4Q9BPW4 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
APOL4Q9BPW4 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
APOL4Q9BPW4 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
APOL4Q9BPW4 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
APOL4Q9BPW4 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
APOL4Q9BPW4 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
APOL4Q9BPW4 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
APOL4Q9BPW4 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
APOL4Q9BPW4 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
APOL4Q9BPW4 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
APOL4Q9BPW4 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
APOL4Q9BPW4 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
APOL4Q9BPW4 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
APOL4Q9BPW4 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
APOL4Q9BPW4 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
APOL4Q9BPW4 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
APOL4Q9BPW4 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
APOL4Q9BPW4 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
APOL4Q9BPW4 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
APOL4Q9BPW4 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
APOL4Q9BPW4 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
APOL4Q9BPW4 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
APOL4Q9BPW4 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
APOL4Q9BPW4 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
APOL4Q9BPW4 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
APOL4Q9BPW4 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
APOL4Q9BPW4 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
APOL4Q9BPW4 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
APOL4Q9BPW4 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
APOL4Q9BPW4 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
APOL4Q9BPW4 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
APOL4Q9BPW4 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
APOL4Q9BPW4 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
APOL4Q9BPW4 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
APOL4Q9BPW4 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
APOL4Q9BPW4 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
APOL4Q9BPW4 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
APOL4Q9BPW4 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
APOL4Q9BPW4 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
APOL4Q9BPW4 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
APOL4Q9BPW4 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
APOL4Q9BPW4 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
APOL4Q9BPW4 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
APOL4Q9BPW4 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
APOL4Q9BPW4 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
APOL4Q9BPW4 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
APOL4Q9BPW4 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
APOL4Q9BPW4 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
APOL4Q9BPW4 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
APOL4Q9BPW4 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
APOL4Q9BPW4 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
APOL4Q9BPW4 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
APOL4Q9BPW4 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
APOL4Q9BPW4 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
APOL4Q9BPW4 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
APOL4Q9BPW4 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
APOL4Q9BPW4 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
APOL4Q9BPW4 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
APOL4Q9BPW4 GRM1-203ENST00000361719 6754 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
APOL4Q9BPW4 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
APOL4Q9BPW4 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
APOL4Q9BPW4 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
APOL4Q9BPW4 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
APOL4Q9BPW4 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
APOL4Q9BPW4 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
APOL4Q9BPW4 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
APOL4Q9BPW4 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
APOL4Q9BPW4 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
APOL4Q9BPW4 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
APOL4Q9BPW4 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
APOL4Q9BPW4 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
APOL4Q9BPW4 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
APOL4Q9BPW4 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
APOL4Q9BPW4 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
APOL4Q9BPW4 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
APOL4Q9BPW4 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
APOL4Q9BPW4 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
APOL4Q9BPW4 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
APOL4Q9BPW4 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
APOL4Q9BPW4 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
APOL4Q9BPW4 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
APOL4Q9BPW4 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
APOL4Q9BPW4 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
APOL4Q9BPW4 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
APOL4Q9BPW4 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
APOL4Q9BPW4 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
APOL4Q9BPW4 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
APOL4Q9BPW4 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
APOL4Q9BPW4 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
APOL4Q9BPW4 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
APOL4Q9BPW4 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
APOL4Q9BPW4 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
APOL4Q9BPW4 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
APOL4Q9BPW4 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
APOL4Q9BPW4 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
APOL4Q9BPW4 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.3 ms