Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
PITX2Q99697 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
PITX2Q99697 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
PITX2Q99697 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
PITX2Q99697 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
PITX2Q99697 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
PITX2Q99697 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
PITX2Q99697 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
PITX2Q99697 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
PITX2Q99697 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
PITX2Q99697 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PITX2Q99697 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
PITX2Q99697 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
PITX2Q99697 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
PITX2Q99697 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
PITX2Q99697 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC14.27□□□□□ -0.13
PITX2Q99697 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
PITX2Q99697 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
PITX2Q99697 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
PITX2Q99697 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
PITX2Q99697 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PITX2Q99697 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
PITX2Q99697 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PITX2Q99697 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PITX2Q99697 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PITX2Q99697 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PITX2Q99697 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PITX2Q99697 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PITX2Q99697 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PITX2Q99697 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PITX2Q99697 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
PITX2Q99697 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
PITX2Q99697 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PITX2Q99697 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
PITX2Q99697 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PITX2Q99697 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
PITX2Q99697 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
PITX2Q99697 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PITX2Q99697 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PITX2Q99697 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PITX2Q99697 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PITX2Q99697 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PITX2Q99697 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PITX2Q99697 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PITX2Q99697 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PITX2Q99697 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
PITX2Q99697 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PITX2Q99697 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PITX2Q99697 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PITX2Q99697 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PITX2Q99697 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PITX2Q99697 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PITX2Q99697 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PITX2Q99697 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PITX2Q99697 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PITX2Q99697 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PITX2Q99697 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PITX2Q99697 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PITX2Q99697 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PITX2Q99697 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PITX2Q99697 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PITX2Q99697 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PITX2Q99697 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PITX2Q99697 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PITX2Q99697 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PITX2Q99697 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PITX2Q99697 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
PITX2Q99697 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
PITX2Q99697 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PITX2Q99697 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PITX2Q99697 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PITX2Q99697 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PITX2Q99697 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PITX2Q99697 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PITX2Q99697 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
PITX2Q99697 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PITX2Q99697 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PITX2Q99697 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PITX2Q99697 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PITX2Q99697 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PITX2Q99697 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PITX2Q99697 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PITX2Q99697 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PITX2Q99697 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PITX2Q99697 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
PITX2Q99697 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PITX2Q99697 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
PITX2Q99697 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PITX2Q99697 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PITX2Q99697 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PITX2Q99697 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PITX2Q99697 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PITX2Q99697 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PITX2Q99697 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PITX2Q99697 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PITX2Q99697 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
PITX2Q99697 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PITX2Q99697 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PITX2Q99697 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PITX2Q99697 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms