Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT7

C9orf72, Guanine nucleotide exchange C9orf72, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf72Q96LT7 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms