Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SAMD8Q96LT4 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SAMD8Q96LT4 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SAMD8Q96LT4 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SAMD8Q96LT4 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SAMD8Q96LT4 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SAMD8Q96LT4 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
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SAMD8Q96LT4 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SAMD8Q96LT4 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SAMD8Q96LT4 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
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SAMD8Q96LT4 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SAMD8Q96LT4 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SAMD8Q96LT4 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SAMD8Q96LT4 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
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SAMD8Q96LT4 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SAMD8Q96LT4 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SAMD8Q96LT4 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SAMD8Q96LT4 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SAMD8Q96LT4 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SAMD8Q96LT4 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SAMD8Q96LT4 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
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SAMD8Q96LT4 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SAMD8Q96LT4 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SAMD8Q96LT4 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
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SAMD8Q96LT4 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
SAMD8Q96LT4 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
SAMD8Q96LT4 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SAMD8Q96LT4 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
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SAMD8Q96LT4 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC14.15□□□□□ -0.14
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SAMD8Q96LT4 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
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SAMD8Q96LT4 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
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SAMD8Q96LT4 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
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SAMD8Q96LT4 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SAMD8Q96LT4 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SAMD8Q96LT4 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
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SAMD8Q96LT4 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
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SAMD8Q96LT4 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SAMD8Q96LT4 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SAMD8Q96LT4 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SAMD8Q96LT4 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
SAMD8Q96LT4 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SAMD8Q96LT4 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
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SAMD8Q96LT4 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SAMD8Q96LT4 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SAMD8Q96LT4 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SAMD8Q96LT4 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SAMD8Q96LT4 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SAMD8Q96LT4 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SAMD8Q96LT4 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SAMD8Q96LT4 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SAMD8Q96LT4 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SAMD8Q96LT4 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SAMD8Q96LT4 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SAMD8Q96LT4 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SAMD8Q96LT4 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SAMD8Q96LT4 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SAMD8Q96LT4 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
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