Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD8

SENP8, Sentrin-specific protease 8, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP8Q96LD8 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SENP8Q96LD8 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SENP8Q96LD8 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SENP8Q96LD8 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SENP8Q96LD8 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SENP8Q96LD8 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SENP8Q96LD8 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SENP8Q96LD8 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SENP8Q96LD8 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SENP8Q96LD8 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SENP8Q96LD8 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SENP8Q96LD8 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SENP8Q96LD8 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SENP8Q96LD8 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SENP8Q96LD8 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SENP8Q96LD8 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SENP8Q96LD8 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SENP8Q96LD8 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SENP8Q96LD8 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SENP8Q96LD8 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SENP8Q96LD8 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SENP8Q96LD8 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SENP8Q96LD8 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SENP8Q96LD8 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SENP8Q96LD8 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SENP8Q96LD8 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SENP8Q96LD8 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SENP8Q96LD8 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SENP8Q96LD8 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SENP8Q96LD8 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SENP8Q96LD8 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SENP8Q96LD8 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SENP8Q96LD8 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SENP8Q96LD8 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SENP8Q96LD8 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SENP8Q96LD8 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SENP8Q96LD8 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SENP8Q96LD8 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SENP8Q96LD8 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SENP8Q96LD8 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SENP8Q96LD8 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SENP8Q96LD8 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SENP8Q96LD8 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SENP8Q96LD8 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SENP8Q96LD8 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SENP8Q96LD8 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SENP8Q96LD8 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SENP8Q96LD8 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SENP8Q96LD8 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SENP8Q96LD8 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SENP8Q96LD8 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SENP8Q96LD8 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SENP8Q96LD8 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SENP8Q96LD8 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SENP8Q96LD8 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SENP8Q96LD8 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SENP8Q96LD8 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SENP8Q96LD8 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SENP8Q96LD8 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SENP8Q96LD8 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SENP8Q96LD8 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SENP8Q96LD8 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SENP8Q96LD8 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SENP8Q96LD8 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SENP8Q96LD8 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SENP8Q96LD8 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SENP8Q96LD8 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SENP8Q96LD8 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SENP8Q96LD8 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SENP8Q96LD8 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SENP8Q96LD8 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SENP8Q96LD8 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SENP8Q96LD8 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SENP8Q96LD8 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SENP8Q96LD8 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SENP8Q96LD8 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SENP8Q96LD8 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SENP8Q96LD8 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SENP8Q96LD8 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SENP8Q96LD8 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SENP8Q96LD8 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SENP8Q96LD8 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SENP8Q96LD8 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SENP8Q96LD8 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SENP8Q96LD8 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SENP8Q96LD8 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SENP8Q96LD8 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SENP8Q96LD8 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SENP8Q96LD8 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SENP8Q96LD8 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SENP8Q96LD8 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SENP8Q96LD8 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SENP8Q96LD8 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SENP8Q96LD8 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SENP8Q96LD8 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SENP8Q96LD8 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SENP8Q96LD8 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SENP8Q96LD8 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SENP8Q96LD8 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SENP8Q96LD8 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms