Protein–RNA interactions for Protein: Q96L96

ALPK3, Alpha-protein kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALPK3Q96L96 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ALPK3Q96L96 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ALPK3Q96L96 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ALPK3Q96L96 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ALPK3Q96L96 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ALPK3Q96L96 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ALPK3Q96L96 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ALPK3Q96L96 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ALPK3Q96L96 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ALPK3Q96L96 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ALPK3Q96L96 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ALPK3Q96L96 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ALPK3Q96L96 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ALPK3Q96L96 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ALPK3Q96L96 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ALPK3Q96L96 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ALPK3Q96L96 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ALPK3Q96L96 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ALPK3Q96L96 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ALPK3Q96L96 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ALPK3Q96L96 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ALPK3Q96L96 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ALPK3Q96L96 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ALPK3Q96L96 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ALPK3Q96L96 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ALPK3Q96L96 AL390778.2-201ENST00000420883 886 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ALPK3Q96L96 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ALPK3Q96L96 PGAM1P12-201ENST00000505622 748 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ALPK3Q96L96 FAM86KP-201ENST00000509817 987 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ALPK3Q96L96 TMEM126A-203ENST00000528105 656 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ALPK3Q96L96 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ALPK3Q96L96 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ALPK3Q96L96 CSAG3-203ENST00000638835 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ALPK3Q96L96 CSAG2-204ENST00000640702 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ALPK3Q96L96 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ALPK3Q96L96 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ALPK3Q96L96 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALPK3Q96L96 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALPK3Q96L96 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALPK3Q96L96 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALPK3Q96L96 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALPK3Q96L96 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALPK3Q96L96 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALPK3Q96L96 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALPK3Q96L96 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALPK3Q96L96 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALPK3Q96L96 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALPK3Q96L96 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALPK3Q96L96 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALPK3Q96L96 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALPK3Q96L96 FAM3B-201ENST00000357985 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALPK3Q96L96 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALPK3Q96L96 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ALPK3Q96L96 AC244197.1-201ENST00000456494 951 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ALPK3Q96L96 DMKN-256ENST00000492341 738 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALPK3Q96L96 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALPK3Q96L96 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALPK3Q96L96 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALPK3Q96L96 PIGT-208ENST00000545755 1158 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALPK3Q96L96 ATP2A1-AS1-201ENST00000561547 558 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALPK3Q96L96 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALPK3Q96L96 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALPK3Q96L96 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALPK3Q96L96 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALPK3Q96L96 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALPK3Q96L96 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALPK3Q96L96 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALPK3Q96L96 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALPK3Q96L96 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ALPK3Q96L96 CHRNA1-203ENST00000409219 1466 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ALPK3Q96L96 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ALPK3Q96L96 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ALPK3Q96L96 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ALPK3Q96L96 INS-IGF2-202ENST00000397270 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ALPK3Q96L96 RAD51C-203ENST00000421782 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ALPK3Q96L96 HIGD1A-203ENST00000430190 741 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ALPK3Q96L96 LINC02557-201ENST00000432249 477 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ALPK3Q96L96 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ALPK3Q96L96 AGPAT5P1-201ENST00000455855 1019 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ALPK3Q96L96 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ALPK3Q96L96 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ALPK3Q96L96 RPS5-204ENST00000598098 536 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ALPK3Q96L96 ADSL-201ENST00000216194 1620 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ALPK3Q96L96 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ALPK3Q96L96 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ALPK3Q96L96 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ALPK3Q96L96 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ALPK3Q96L96 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ALPK3Q96L96 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ALPK3Q96L96 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ALPK3Q96L96 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ALPK3Q96L96 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ALPK3Q96L96 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ALPK3Q96L96 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ALPK3Q96L96 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ALPK3Q96L96 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ALPK3Q96L96 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ALPK3Q96L96 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ALPK3Q96L96 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ALPK3Q96L96 THY1-209ENST00000580275 578 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms