Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX1

SMIM12, Small integral membrane protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM12Q96EX1 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 DMAC1-201ENST00000358227 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 CHL1-201ENST00000256509 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 ERAP1-201ENST00000296754 5495 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 NSD2-206ENST00000382895 7827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 CHRFAM7A-201ENST00000299847 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 PLXNB1-201ENST00000296440 7143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 ARHGAP20-201ENST00000260283 6189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 SMIM14-201ENST00000295958 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 TRAF3-208ENST00000560371 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 ZNF519-206ENST00000589498 2117 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 TCF4-248ENST00000616053 8140 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms