Protein–RNA interactions for Protein: Q96DC9

OTUB2, Ubiquitin thioesterase OTUB2, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUB2Q96DC9 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
OTUB2Q96DC9 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
OTUB2Q96DC9 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
OTUB2Q96DC9 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
OTUB2Q96DC9 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
OTUB2Q96DC9 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
OTUB2Q96DC9 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
OTUB2Q96DC9 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
OTUB2Q96DC9 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
OTUB2Q96DC9 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
OTUB2Q96DC9 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
OTUB2Q96DC9 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
OTUB2Q96DC9 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
OTUB2Q96DC9 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
OTUB2Q96DC9 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
OTUB2Q96DC9 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
OTUB2Q96DC9 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
OTUB2Q96DC9 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
OTUB2Q96DC9 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
OTUB2Q96DC9 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
OTUB2Q96DC9 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
OTUB2Q96DC9 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
OTUB2Q96DC9 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
OTUB2Q96DC9 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
OTUB2Q96DC9 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
OTUB2Q96DC9 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
OTUB2Q96DC9 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
OTUB2Q96DC9 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
OTUB2Q96DC9 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
OTUB2Q96DC9 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
OTUB2Q96DC9 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
OTUB2Q96DC9 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
OTUB2Q96DC9 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
OTUB2Q96DC9 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
OTUB2Q96DC9 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
OTUB2Q96DC9 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
OTUB2Q96DC9 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
OTUB2Q96DC9 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
OTUB2Q96DC9 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
OTUB2Q96DC9 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
OTUB2Q96DC9 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
OTUB2Q96DC9 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
OTUB2Q96DC9 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
OTUB2Q96DC9 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
OTUB2Q96DC9 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
OTUB2Q96DC9 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
OTUB2Q96DC9 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
OTUB2Q96DC9 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
OTUB2Q96DC9 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
OTUB2Q96DC9 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
OTUB2Q96DC9 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
OTUB2Q96DC9 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
OTUB2Q96DC9 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
OTUB2Q96DC9 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
OTUB2Q96DC9 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
OTUB2Q96DC9 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
OTUB2Q96DC9 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
OTUB2Q96DC9 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
OTUB2Q96DC9 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
OTUB2Q96DC9 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
OTUB2Q96DC9 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
OTUB2Q96DC9 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
OTUB2Q96DC9 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
OTUB2Q96DC9 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
OTUB2Q96DC9 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
OTUB2Q96DC9 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
OTUB2Q96DC9 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
OTUB2Q96DC9 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
OTUB2Q96DC9 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
OTUB2Q96DC9 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
OTUB2Q96DC9 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
OTUB2Q96DC9 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
OTUB2Q96DC9 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
OTUB2Q96DC9 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
OTUB2Q96DC9 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
OTUB2Q96DC9 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
OTUB2Q96DC9 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
OTUB2Q96DC9 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
OTUB2Q96DC9 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
OTUB2Q96DC9 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
OTUB2Q96DC9 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
OTUB2Q96DC9 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
OTUB2Q96DC9 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
OTUB2Q96DC9 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
OTUB2Q96DC9 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
OTUB2Q96DC9 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
OTUB2Q96DC9 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
OTUB2Q96DC9 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
OTUB2Q96DC9 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
OTUB2Q96DC9 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
OTUB2Q96DC9 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
OTUB2Q96DC9 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
OTUB2Q96DC9 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
OTUB2Q96DC9 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
OTUB2Q96DC9 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
OTUB2Q96DC9 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
OTUB2Q96DC9 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
OTUB2Q96DC9 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
OTUB2Q96DC9 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
OTUB2Q96DC9 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.8 ms