Protein–RNA interactions for Protein: Q96B97

SH3KBP1, SH3 domain-containing kinase-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3KBP1Q96B97 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3KBP1Q96B97 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3KBP1Q96B97 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3KBP1Q96B97 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3KBP1Q96B97 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3KBP1Q96B97 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3KBP1Q96B97 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3KBP1Q96B97 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3KBP1Q96B97 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3KBP1Q96B97 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3KBP1Q96B97 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3KBP1Q96B97 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3KBP1Q96B97 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3KBP1Q96B97 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3KBP1Q96B97 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3KBP1Q96B97 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3KBP1Q96B97 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3KBP1Q96B97 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3KBP1Q96B97 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3KBP1Q96B97 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3KBP1Q96B97 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3KBP1Q96B97 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3KBP1Q96B97 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3KBP1Q96B97 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3KBP1Q96B97 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3KBP1Q96B97 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3KBP1Q96B97 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3KBP1Q96B97 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3KBP1Q96B97 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3KBP1Q96B97 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3KBP1Q96B97 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3KBP1Q96B97 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3KBP1Q96B97 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3KBP1Q96B97 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3KBP1Q96B97 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3KBP1Q96B97 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3KBP1Q96B97 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3KBP1Q96B97 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3KBP1Q96B97 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3KBP1Q96B97 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3KBP1Q96B97 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3KBP1Q96B97 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3KBP1Q96B97 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3KBP1Q96B97 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3KBP1Q96B97 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3KBP1Q96B97 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3KBP1Q96B97 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3KBP1Q96B97 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3KBP1Q96B97 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3KBP1Q96B97 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3KBP1Q96B97 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3KBP1Q96B97 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3KBP1Q96B97 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3KBP1Q96B97 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3KBP1Q96B97 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3KBP1Q96B97 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3KBP1Q96B97 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3KBP1Q96B97 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3KBP1Q96B97 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3KBP1Q96B97 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3KBP1Q96B97 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3KBP1Q96B97 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3KBP1Q96B97 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3KBP1Q96B97 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3KBP1Q96B97 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3KBP1Q96B97 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3KBP1Q96B97 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3KBP1Q96B97 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3KBP1Q96B97 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3KBP1Q96B97 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3KBP1Q96B97 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3KBP1Q96B97 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3KBP1Q96B97 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3KBP1Q96B97 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3KBP1Q96B97 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3KBP1Q96B97 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3KBP1Q96B97 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3KBP1Q96B97 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3KBP1Q96B97 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3KBP1Q96B97 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3KBP1Q96B97 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3KBP1Q96B97 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3KBP1Q96B97 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3KBP1Q96B97 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3KBP1Q96B97 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3KBP1Q96B97 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3KBP1Q96B97 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3KBP1Q96B97 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3KBP1Q96B97 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3KBP1Q96B97 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3KBP1Q96B97 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3KBP1Q96B97 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3KBP1Q96B97 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3KBP1Q96B97 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3KBP1Q96B97 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3KBP1Q96B97 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3KBP1Q96B97 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3KBP1Q96B97 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3KBP1Q96B97 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3KBP1Q96B97 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms