Protein–RNA interactions for Protein: Q92954

PRG4, Proteoglycan 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG4Q92954 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PRG4Q92954 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PRG4Q92954 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRG4Q92954 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PRG4Q92954 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRG4Q92954 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PRG4Q92954 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
PRG4Q92954 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
PRG4Q92954 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
PRG4Q92954 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PRG4Q92954 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PRG4Q92954 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRG4Q92954 CLNS1A-211ENST00000532069 898 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
PRG4Q92954 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
PRG4Q92954 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PRG4Q92954 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
PRG4Q92954 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PRG4Q92954 AP003392.6-201ENST00000607709 325 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PRG4Q92954 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PRG4Q92954 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PRG4Q92954 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PRG4Q92954 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRG4Q92954 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRG4Q92954 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRG4Q92954 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRG4Q92954 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRG4Q92954 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRG4Q92954 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRG4Q92954 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRG4Q92954 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRG4Q92954 AC061961.1-201ENST00000443901 432 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRG4Q92954 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PRG4Q92954 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRG4Q92954 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRG4Q92954 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRG4Q92954 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRG4Q92954 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PRG4Q92954 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PRG4Q92954 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRG4Q92954 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRG4Q92954 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRG4Q92954 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRG4Q92954 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRG4Q92954 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRG4Q92954 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRG4Q92954 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRG4Q92954 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRG4Q92954 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRG4Q92954 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRG4Q92954 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRG4Q92954 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRG4Q92954 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRG4Q92954 LINC01868-201ENST00000414965 562 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRG4Q92954 C8orf31-207ENST00000524181 1199 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRG4Q92954 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRG4Q92954 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRG4Q92954 AC093567.1-201ENST00000590649 877 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRG4Q92954 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PRG4Q92954 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRG4Q92954 AC244250.3-201ENST00000620749 366 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PRG4Q92954 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRG4Q92954 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRG4Q92954 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRG4Q92954 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRG4Q92954 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRG4Q92954 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRG4Q92954 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRG4Q92954 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRG4Q92954 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRG4Q92954 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRG4Q92954 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRG4Q92954 CNRIP1-202ENST00000409559 644 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRG4Q92954 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRG4Q92954 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRG4Q92954 EIF5AP2-201ENST00000585668 1047 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PRG4Q92954 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PRG4Q92954 MYOZ3-209ENST00000615557 1031 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRG4Q92954 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRG4Q92954 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRG4Q92954 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRG4Q92954 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRG4Q92954 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRG4Q92954 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRG4Q92954 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRG4Q92954 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRG4Q92954 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRG4Q92954 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRG4Q92954 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRG4Q92954 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRG4Q92954 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRG4Q92954 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRG4Q92954 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRG4Q92954 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRG4Q92954 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PRG4Q92954 PSMD4P1-201ENST00000433951 1109 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PRG4Q92954 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRG4Q92954 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRG4Q92954 TMBIM4-208ENST00000542724 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRG4Q92954 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRG4Q92954 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms