Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ74

CTTNBP2, Cortactin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,663 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNBP2Q8WZ74 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTTNBP2Q8WZ74 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTTNBP2Q8WZ74 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTTNBP2Q8WZ74 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTTNBP2Q8WZ74 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTTNBP2Q8WZ74 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTTNBP2Q8WZ74 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTTNBP2Q8WZ74 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTTNBP2Q8WZ74 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTTNBP2Q8WZ74 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTTNBP2Q8WZ74 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTTNBP2Q8WZ74 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTTNBP2Q8WZ74 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTTNBP2Q8WZ74 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTTNBP2Q8WZ74 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTTNBP2Q8WZ74 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTTNBP2Q8WZ74 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTTNBP2Q8WZ74 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CTTNBP2Q8WZ74 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTTNBP2Q8WZ74 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTTNBP2Q8WZ74 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTTNBP2Q8WZ74 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTTNBP2Q8WZ74 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTTNBP2Q8WZ74 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTTNBP2Q8WZ74 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTTNBP2Q8WZ74 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTTNBP2Q8WZ74 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTTNBP2Q8WZ74 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTTNBP2Q8WZ74 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTTNBP2Q8WZ74 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTTNBP2Q8WZ74 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTTNBP2Q8WZ74 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTTNBP2Q8WZ74 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTTNBP2Q8WZ74 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTTNBP2Q8WZ74 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CTTNBP2Q8WZ74 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTTNBP2Q8WZ74 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTTNBP2Q8WZ74 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTTNBP2Q8WZ74 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTTNBP2Q8WZ74 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTTNBP2Q8WZ74 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTTNBP2Q8WZ74 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTTNBP2Q8WZ74 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTTNBP2Q8WZ74 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTTNBP2Q8WZ74 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTTNBP2Q8WZ74 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTTNBP2Q8WZ74 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTTNBP2Q8WZ74 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CTTNBP2Q8WZ74 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTTNBP2Q8WZ74 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CTTNBP2Q8WZ74 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTTNBP2Q8WZ74 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTTNBP2Q8WZ74 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CTTNBP2Q8WZ74 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTTNBP2Q8WZ74 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTTNBP2Q8WZ74 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTTNBP2Q8WZ74 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTTNBP2Q8WZ74 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTTNBP2Q8WZ74 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTTNBP2Q8WZ74 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTTNBP2Q8WZ74 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTTNBP2Q8WZ74 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTTNBP2Q8WZ74 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTTNBP2Q8WZ74 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTTNBP2Q8WZ74 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTTNBP2Q8WZ74 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTTNBP2Q8WZ74 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTTNBP2Q8WZ74 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTTNBP2Q8WZ74 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTTNBP2Q8WZ74 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTTNBP2Q8WZ74 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTTNBP2Q8WZ74 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTTNBP2Q8WZ74 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CTTNBP2Q8WZ74 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTTNBP2Q8WZ74 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTTNBP2Q8WZ74 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTTNBP2Q8WZ74 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTTNBP2Q8WZ74 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTTNBP2Q8WZ74 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTTNBP2Q8WZ74 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTTNBP2Q8WZ74 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTTNBP2Q8WZ74 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTTNBP2Q8WZ74 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTTNBP2Q8WZ74 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTTNBP2Q8WZ74 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTTNBP2Q8WZ74 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CTTNBP2Q8WZ74 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTTNBP2Q8WZ74 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTTNBP2Q8WZ74 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CTTNBP2Q8WZ74 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTTNBP2Q8WZ74 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTTNBP2Q8WZ74 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTTNBP2Q8WZ74 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTTNBP2Q8WZ74 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTTNBP2Q8WZ74 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTTNBP2Q8WZ74 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTTNBP2Q8WZ74 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTTNBP2Q8WZ74 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTTNBP2Q8WZ74 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTTNBP2Q8WZ74 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms