Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXD2

SCG3, Secretogranin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG3Q8WXD2 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SCG3Q8WXD2 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCG3Q8WXD2 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCG3Q8WXD2 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SCG3Q8WXD2 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SCG3Q8WXD2 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCG3Q8WXD2 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCG3Q8WXD2 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
SCG3Q8WXD2 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SCG3Q8WXD2 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
SCG3Q8WXD2 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SCG3Q8WXD2 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCG3Q8WXD2 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SCG3Q8WXD2 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SCG3Q8WXD2 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCG3Q8WXD2 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SCG3Q8WXD2 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SCG3Q8WXD2 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCG3Q8WXD2 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SCG3Q8WXD2 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SCG3Q8WXD2 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SCG3Q8WXD2 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SCG3Q8WXD2 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SCG3Q8WXD2 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCG3Q8WXD2 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCG3Q8WXD2 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SCG3Q8WXD2 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SCG3Q8WXD2 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCG3Q8WXD2 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCG3Q8WXD2 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SCG3Q8WXD2 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCG3Q8WXD2 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCG3Q8WXD2 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCG3Q8WXD2 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCG3Q8WXD2 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCG3Q8WXD2 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCG3Q8WXD2 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCG3Q8WXD2 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCG3Q8WXD2 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCG3Q8WXD2 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCG3Q8WXD2 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCG3Q8WXD2 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCG3Q8WXD2 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCG3Q8WXD2 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCG3Q8WXD2 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCG3Q8WXD2 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCG3Q8WXD2 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCG3Q8WXD2 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCG3Q8WXD2 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCG3Q8WXD2 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCG3Q8WXD2 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCG3Q8WXD2 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCG3Q8WXD2 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCG3Q8WXD2 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SCG3Q8WXD2 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SCG3Q8WXD2 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCG3Q8WXD2 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCG3Q8WXD2 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCG3Q8WXD2 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCG3Q8WXD2 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCG3Q8WXD2 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCG3Q8WXD2 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCG3Q8WXD2 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCG3Q8WXD2 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCG3Q8WXD2 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCG3Q8WXD2 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCG3Q8WXD2 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCG3Q8WXD2 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCG3Q8WXD2 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCG3Q8WXD2 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCG3Q8WXD2 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCG3Q8WXD2 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCG3Q8WXD2 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCG3Q8WXD2 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCG3Q8WXD2 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCG3Q8WXD2 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCG3Q8WXD2 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCG3Q8WXD2 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCG3Q8WXD2 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCG3Q8WXD2 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCG3Q8WXD2 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCG3Q8WXD2 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCG3Q8WXD2 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCG3Q8WXD2 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCG3Q8WXD2 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SCG3Q8WXD2 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCG3Q8WXD2 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SCG3Q8WXD2 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SCG3Q8WXD2 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCG3Q8WXD2 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCG3Q8WXD2 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCG3Q8WXD2 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCG3Q8WXD2 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCG3Q8WXD2 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCG3Q8WXD2 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCG3Q8WXD2 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCG3Q8WXD2 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCG3Q8WXD2 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCG3Q8WXD2 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCG3Q8WXD2 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
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