Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWL2

SUSD1, Sushi domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD1Q6UWL2 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SUSD1Q6UWL2 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms