Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 1,325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZBED9Q6R2W3 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZBED9Q6R2W3 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZBED9Q6R2W3 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZBED9Q6R2W3 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZBED9Q6R2W3 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZBED9Q6R2W3 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZBED9Q6R2W3 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZBED9Q6R2W3 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZBED9Q6R2W3 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZBED9Q6R2W3 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZBED9Q6R2W3 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZBED9Q6R2W3 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZBED9Q6R2W3 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZBED9Q6R2W3 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZBED9Q6R2W3 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZBED9Q6R2W3 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZBED9Q6R2W3 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZBED9Q6R2W3 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZBED9Q6R2W3 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZBED9Q6R2W3 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZBED9Q6R2W3 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZBED9Q6R2W3 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
ZBED9Q6R2W3 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZBED9Q6R2W3 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZBED9Q6R2W3 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZBED9Q6R2W3 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZBED9Q6R2W3 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZBED9Q6R2W3 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZBED9Q6R2W3 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZBED9Q6R2W3 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
ZBED9Q6R2W3 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
ZBED9Q6R2W3 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZBED9Q6R2W3 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZBED9Q6R2W3 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZBED9Q6R2W3 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZBED9Q6R2W3 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZBED9Q6R2W3 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZBED9Q6R2W3 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZBED9Q6R2W3 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZBED9Q6R2W3 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZBED9Q6R2W3 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZBED9Q6R2W3 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
ZBED9Q6R2W3 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
ZBED9Q6R2W3 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
ZBED9Q6R2W3 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ZBED9Q6R2W3 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ZBED9Q6R2W3 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ZBED9Q6R2W3 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ZBED9Q6R2W3 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ZBED9Q6R2W3 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ZBED9Q6R2W3 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZBED9Q6R2W3 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZBED9Q6R2W3 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZBED9Q6R2W3 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZBED9Q6R2W3 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZBED9Q6R2W3 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
ZBED9Q6R2W3 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZBED9Q6R2W3 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZBED9Q6R2W3 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZBED9Q6R2W3 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZBED9Q6R2W3 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZBED9Q6R2W3 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZBED9Q6R2W3 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZBED9Q6R2W3 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
ZBED9Q6R2W3 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZBED9Q6R2W3 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
ZBED9Q6R2W3 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZBED9Q6R2W3 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZBED9Q6R2W3 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZBED9Q6R2W3 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZBED9Q6R2W3 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZBED9Q6R2W3 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZBED9Q6R2W3 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZBED9Q6R2W3 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZBED9Q6R2W3 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZBED9Q6R2W3 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZBED9Q6R2W3 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZBED9Q6R2W3 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZBED9Q6R2W3 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZBED9Q6R2W3 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZBED9Q6R2W3 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZBED9Q6R2W3 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZBED9Q6R2W3 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZBED9Q6R2W3 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZBED9Q6R2W3 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZBED9Q6R2W3 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZBED9Q6R2W3 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZBED9Q6R2W3 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZBED9Q6R2W3 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZBED9Q6R2W3 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZBED9Q6R2W3 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZBED9Q6R2W3 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZBED9Q6R2W3 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZBED9Q6R2W3 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZBED9Q6R2W3 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZBED9Q6R2W3 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZBED9Q6R2W3 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZBED9Q6R2W3 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ZBED9Q6R2W3 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
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