Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Q0

LETMD1, LETM1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1Q6P1Q0 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.03■□□□□ -0
LETMD1Q6P1Q0 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LETMD1Q6P1Q0 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.03■□□□□ -0
LETMD1Q6P1Q0 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LETMD1Q6P1Q0 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LETMD1Q6P1Q0 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
LETMD1Q6P1Q0 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LETMD1Q6P1Q0 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
LETMD1Q6P1Q0 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
LETMD1Q6P1Q0 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LETMD1Q6P1Q0 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LETMD1Q6P1Q0 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.02■□□□□ -0
LETMD1Q6P1Q0 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LETMD1Q6P1Q0 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LETMD1Q6P1Q0 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
LETMD1Q6P1Q0 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LETMD1Q6P1Q0 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LETMD1Q6P1Q0 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
LETMD1Q6P1Q0 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LETMD1Q6P1Q0 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
LETMD1Q6P1Q0 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.02■□□□□ -0
LETMD1Q6P1Q0 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LETMD1Q6P1Q0 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
LETMD1Q6P1Q0 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LETMD1Q6P1Q0 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
LETMD1Q6P1Q0 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LETMD1Q6P1Q0 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
LETMD1Q6P1Q0 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
LETMD1Q6P1Q0 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
LETMD1Q6P1Q0 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.02■□□□□ -0
LETMD1Q6P1Q0 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LETMD1Q6P1Q0 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
LETMD1Q6P1Q0 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LETMD1Q6P1Q0 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LETMD1Q6P1Q0 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LETMD1Q6P1Q0 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
LETMD1Q6P1Q0 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC15.02■□□□□ -0
LETMD1Q6P1Q0 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
LETMD1Q6P1Q0 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
LETMD1Q6P1Q0 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.02■□□□□ -0
LETMD1Q6P1Q0 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC15.02■□□□□ -0
LETMD1Q6P1Q0 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
LETMD1Q6P1Q0 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
LETMD1Q6P1Q0 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
LETMD1Q6P1Q0 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LETMD1Q6P1Q0 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.02■□□□□ -0
LETMD1Q6P1Q0 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
LETMD1Q6P1Q0 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
LETMD1Q6P1Q0 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.02■□□□□ -0
LETMD1Q6P1Q0 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LETMD1Q6P1Q0 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LETMD1Q6P1Q0 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
LETMD1Q6P1Q0 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LETMD1Q6P1Q0 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LETMD1Q6P1Q0 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
LETMD1Q6P1Q0 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
LETMD1Q6P1Q0 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LETMD1Q6P1Q0 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LETMD1Q6P1Q0 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
LETMD1Q6P1Q0 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LETMD1Q6P1Q0 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
LETMD1Q6P1Q0 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LETMD1Q6P1Q0 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LETMD1Q6P1Q0 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LETMD1Q6P1Q0 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LETMD1Q6P1Q0 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
LETMD1Q6P1Q0 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LETMD1Q6P1Q0 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LETMD1Q6P1Q0 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
LETMD1Q6P1Q0 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LETMD1Q6P1Q0 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LETMD1Q6P1Q0 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LETMD1Q6P1Q0 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
LETMD1Q6P1Q0 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LETMD1Q6P1Q0 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LETMD1Q6P1Q0 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LETMD1Q6P1Q0 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LETMD1Q6P1Q0 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LETMD1Q6P1Q0 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LETMD1Q6P1Q0 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LETMD1Q6P1Q0 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LETMD1Q6P1Q0 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LETMD1Q6P1Q0 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LETMD1Q6P1Q0 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LETMD1Q6P1Q0 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LETMD1Q6P1Q0 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LETMD1Q6P1Q0 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LETMD1Q6P1Q0 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LETMD1Q6P1Q0 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LETMD1Q6P1Q0 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LETMD1Q6P1Q0 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LETMD1Q6P1Q0 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LETMD1Q6P1Q0 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LETMD1Q6P1Q0 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LETMD1Q6P1Q0 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LETMD1Q6P1Q0 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LETMD1Q6P1Q0 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LETMD1Q6P1Q0 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LETMD1Q6P1Q0 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LETMD1Q6P1Q0 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms