Protein–RNA interactions for Protein: Q68DU8

KCTD16, BTB/POZ domain-containing protein KCTD16, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD16Q68DU8 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCTD16Q68DU8 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCTD16Q68DU8 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
KCTD16Q68DU8 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCTD16Q68DU8 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCTD16Q68DU8 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCTD16Q68DU8 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCTD16Q68DU8 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCTD16Q68DU8 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCTD16Q68DU8 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCTD16Q68DU8 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCTD16Q68DU8 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCTD16Q68DU8 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCTD16Q68DU8 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCTD16Q68DU8 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
KCTD16Q68DU8 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCTD16Q68DU8 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCTD16Q68DU8 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCTD16Q68DU8 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCTD16Q68DU8 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCTD16Q68DU8 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCTD16Q68DU8 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCTD16Q68DU8 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCTD16Q68DU8 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCTD16Q68DU8 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCTD16Q68DU8 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCTD16Q68DU8 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCTD16Q68DU8 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCTD16Q68DU8 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCTD16Q68DU8 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCTD16Q68DU8 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCTD16Q68DU8 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCTD16Q68DU8 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
KCTD16Q68DU8 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCTD16Q68DU8 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCTD16Q68DU8 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCTD16Q68DU8 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCTD16Q68DU8 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCTD16Q68DU8 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCTD16Q68DU8 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCTD16Q68DU8 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCTD16Q68DU8 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCTD16Q68DU8 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCTD16Q68DU8 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
KCTD16Q68DU8 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCTD16Q68DU8 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCTD16Q68DU8 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCTD16Q68DU8 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCTD16Q68DU8 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCTD16Q68DU8 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCTD16Q68DU8 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCTD16Q68DU8 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCTD16Q68DU8 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCTD16Q68DU8 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCTD16Q68DU8 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCTD16Q68DU8 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCTD16Q68DU8 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCTD16Q68DU8 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCTD16Q68DU8 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCTD16Q68DU8 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCTD16Q68DU8 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCTD16Q68DU8 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCTD16Q68DU8 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCTD16Q68DU8 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCTD16Q68DU8 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
KCTD16Q68DU8 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCTD16Q68DU8 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCTD16Q68DU8 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCTD16Q68DU8 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCTD16Q68DU8 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCTD16Q68DU8 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCTD16Q68DU8 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCTD16Q68DU8 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCTD16Q68DU8 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCTD16Q68DU8 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCTD16Q68DU8 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCTD16Q68DU8 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCTD16Q68DU8 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCTD16Q68DU8 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCTD16Q68DU8 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCTD16Q68DU8 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCTD16Q68DU8 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCTD16Q68DU8 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCTD16Q68DU8 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCTD16Q68DU8 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCTD16Q68DU8 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCTD16Q68DU8 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCTD16Q68DU8 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCTD16Q68DU8 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCTD16Q68DU8 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCTD16Q68DU8 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCTD16Q68DU8 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCTD16Q68DU8 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCTD16Q68DU8 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCTD16Q68DU8 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCTD16Q68DU8 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCTD16Q68DU8 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCTD16Q68DU8 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCTD16Q68DU8 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
KCTD16Q68DU8 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 245.5 ms