Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE7

PHYHD1, Phytanoyl-CoA dioxygenase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHYHD1Q5SRE7 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
PHYHD1Q5SRE7 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
PHYHD1Q5SRE7 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PHYHD1Q5SRE7 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PHYHD1Q5SRE7 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PHYHD1Q5SRE7 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PHYHD1Q5SRE7 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PHYHD1Q5SRE7 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PHYHD1Q5SRE7 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PHYHD1Q5SRE7 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PHYHD1Q5SRE7 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PHYHD1Q5SRE7 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PHYHD1Q5SRE7 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PHYHD1Q5SRE7 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PHYHD1Q5SRE7 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
PHYHD1Q5SRE7 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PHYHD1Q5SRE7 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PHYHD1Q5SRE7 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PHYHD1Q5SRE7 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PHYHD1Q5SRE7 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PHYHD1Q5SRE7 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PHYHD1Q5SRE7 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
PHYHD1Q5SRE7 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PHYHD1Q5SRE7 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PHYHD1Q5SRE7 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PHYHD1Q5SRE7 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PHYHD1Q5SRE7 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PHYHD1Q5SRE7 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PHYHD1Q5SRE7 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PHYHD1Q5SRE7 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PHYHD1Q5SRE7 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PHYHD1Q5SRE7 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PHYHD1Q5SRE7 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PHYHD1Q5SRE7 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PHYHD1Q5SRE7 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PHYHD1Q5SRE7 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PHYHD1Q5SRE7 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
PHYHD1Q5SRE7 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PHYHD1Q5SRE7 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PHYHD1Q5SRE7 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PHYHD1Q5SRE7 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PHYHD1Q5SRE7 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PHYHD1Q5SRE7 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PHYHD1Q5SRE7 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
PHYHD1Q5SRE7 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PHYHD1Q5SRE7 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PHYHD1Q5SRE7 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PHYHD1Q5SRE7 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PHYHD1Q5SRE7 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PHYHD1Q5SRE7 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PHYHD1Q5SRE7 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PHYHD1Q5SRE7 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PHYHD1Q5SRE7 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PHYHD1Q5SRE7 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
PHYHD1Q5SRE7 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
PHYHD1Q5SRE7 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PHYHD1Q5SRE7 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PHYHD1Q5SRE7 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PHYHD1Q5SRE7 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PHYHD1Q5SRE7 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PHYHD1Q5SRE7 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PHYHD1Q5SRE7 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PHYHD1Q5SRE7 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
PHYHD1Q5SRE7 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PHYHD1Q5SRE7 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PHYHD1Q5SRE7 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PHYHD1Q5SRE7 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PHYHD1Q5SRE7 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PHYHD1Q5SRE7 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PHYHD1Q5SRE7 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PHYHD1Q5SRE7 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PHYHD1Q5SRE7 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PHYHD1Q5SRE7 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PHYHD1Q5SRE7 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PHYHD1Q5SRE7 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PHYHD1Q5SRE7 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PHYHD1Q5SRE7 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PHYHD1Q5SRE7 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PHYHD1Q5SRE7 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PHYHD1Q5SRE7 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
PHYHD1Q5SRE7 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
PHYHD1Q5SRE7 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
PHYHD1Q5SRE7 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC13.77□□□□□ -0.2
PHYHD1Q5SRE7 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
PHYHD1Q5SRE7 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
PHYHD1Q5SRE7 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
PHYHD1Q5SRE7 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
PHYHD1Q5SRE7 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
PHYHD1Q5SRE7 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PHYHD1Q5SRE7 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PHYHD1Q5SRE7 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PHYHD1Q5SRE7 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PHYHD1Q5SRE7 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PHYHD1Q5SRE7 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PHYHD1Q5SRE7 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PHYHD1Q5SRE7 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PHYHD1Q5SRE7 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PHYHD1Q5SRE7 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PHYHD1Q5SRE7 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PHYHD1Q5SRE7 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms