Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAB6CQ53S08 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms