Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 ADAM3B-201ENST00000569937 840 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM259Q4ZIN3 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.6 ms