Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZG55

GREB1, Protein GREB1, humanhuman

Predictions only

Length 1,949 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GREB1Q4ZG55 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GREB1Q4ZG55 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.1 ms