Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TWISTNBQ3B726 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TWISTNBQ3B726 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TWISTNBQ3B726 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TWISTNBQ3B726 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TWISTNBQ3B726 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TWISTNBQ3B726 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TWISTNBQ3B726 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TWISTNBQ3B726 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TWISTNBQ3B726 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TWISTNBQ3B726 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TWISTNBQ3B726 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TWISTNBQ3B726 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TWISTNBQ3B726 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TWISTNBQ3B726 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TWISTNBQ3B726 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TWISTNBQ3B726 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TWISTNBQ3B726 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TWISTNBQ3B726 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TWISTNBQ3B726 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TWISTNBQ3B726 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TWISTNBQ3B726 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TWISTNBQ3B726 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TWISTNBQ3B726 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TWISTNBQ3B726 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TWISTNBQ3B726 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TWISTNBQ3B726 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TWISTNBQ3B726 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TWISTNBQ3B726 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TWISTNBQ3B726 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TWISTNBQ3B726 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TWISTNBQ3B726 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TWISTNBQ3B726 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TWISTNBQ3B726 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TWISTNBQ3B726 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TWISTNBQ3B726 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TWISTNBQ3B726 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TWISTNBQ3B726 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TWISTNBQ3B726 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TWISTNBQ3B726 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TWISTNBQ3B726 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TWISTNBQ3B726 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TWISTNBQ3B726 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TWISTNBQ3B726 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TWISTNBQ3B726 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TWISTNBQ3B726 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TWISTNBQ3B726 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TWISTNBQ3B726 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TWISTNBQ3B726 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TWISTNBQ3B726 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TWISTNBQ3B726 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TWISTNBQ3B726 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TWISTNBQ3B726 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
TWISTNBQ3B726 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TWISTNBQ3B726 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TWISTNBQ3B726 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TWISTNBQ3B726 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TWISTNBQ3B726 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TWISTNBQ3B726 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TWISTNBQ3B726 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TWISTNBQ3B726 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TWISTNBQ3B726 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TWISTNBQ3B726 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TWISTNBQ3B726 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TWISTNBQ3B726 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
TWISTNBQ3B726 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
TWISTNBQ3B726 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TWISTNBQ3B726 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TWISTNBQ3B726 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TWISTNBQ3B726 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TWISTNBQ3B726 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TWISTNBQ3B726 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TWISTNBQ3B726 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TWISTNBQ3B726 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TWISTNBQ3B726 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TWISTNBQ3B726 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TWISTNBQ3B726 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TWISTNBQ3B726 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TWISTNBQ3B726 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TWISTNBQ3B726 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TWISTNBQ3B726 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TWISTNBQ3B726 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
TWISTNBQ3B726 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TWISTNBQ3B726 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TWISTNBQ3B726 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TWISTNBQ3B726 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
TWISTNBQ3B726 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TWISTNBQ3B726 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TWISTNBQ3B726 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TWISTNBQ3B726 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TWISTNBQ3B726 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TWISTNBQ3B726 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
TWISTNBQ3B726 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TWISTNBQ3B726 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TWISTNBQ3B726 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
TWISTNBQ3B726 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TWISTNBQ3B726 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TWISTNBQ3B726 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TWISTNBQ3B726 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TWISTNBQ3B726 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms