Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
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