Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RTN1Q16799 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RTN1Q16799 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RTN1Q16799 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RTN1Q16799 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RTN1Q16799 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RTN1Q16799 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RTN1Q16799 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RTN1Q16799 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RTN1Q16799 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RTN1Q16799 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RTN1Q16799 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RTN1Q16799 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RTN1Q16799 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RTN1Q16799 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RTN1Q16799 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RTN1Q16799 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RTN1Q16799 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RTN1Q16799 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RTN1Q16799 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RTN1Q16799 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RTN1Q16799 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RTN1Q16799 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RTN1Q16799 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RTN1Q16799 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RTN1Q16799 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RTN1Q16799 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RTN1Q16799 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RTN1Q16799 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RTN1Q16799 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RTN1Q16799 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RTN1Q16799 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RTN1Q16799 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RTN1Q16799 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RTN1Q16799 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RTN1Q16799 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RTN1Q16799 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RTN1Q16799 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RTN1Q16799 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RTN1Q16799 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RTN1Q16799 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RTN1Q16799 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RTN1Q16799 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RTN1Q16799 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RTN1Q16799 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RTN1Q16799 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RTN1Q16799 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
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RTN1Q16799 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RTN1Q16799 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RTN1Q16799 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RTN1Q16799 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RTN1Q16799 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RTN1Q16799 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RTN1Q16799 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RTN1Q16799 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
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RTN1Q16799 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
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RTN1Q16799 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RTN1Q16799 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RTN1Q16799 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
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RTN1Q16799 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
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RTN1Q16799 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
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RTN1Q16799 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RTN1Q16799 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RTN1Q16799 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RTN1Q16799 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RTN1Q16799 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RTN1Q16799 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RTN1Q16799 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RTN1Q16799 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RTN1Q16799 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RTN1Q16799 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RTN1Q16799 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RTN1Q16799 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RTN1Q16799 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RTN1Q16799 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RTN1Q16799 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RTN1Q16799 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RTN1Q16799 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RTN1Q16799 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RTN1Q16799 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RTN1Q16799 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RTN1Q16799 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RTN1Q16799 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RTN1Q16799 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
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