Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 LINC00634-202ENST00000505157 222 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 HNRNPA1P42-201ENST00000458678 957 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 POLR2E-204ENST00000586746 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 ENPP7P8-202ENST00000527856 1345 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 MIA-206ENST00000597784 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 PSME2-201ENST00000216802 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 GCSHP3-201ENST00000431120 391 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 AC023090.1-201ENST00000592906 502 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 AC010335.1-201ENST00000594590 599 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 CD79B-201ENST00000006750 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 TNNI2-201ENST00000252898 678 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 PMF1-202ENST00000368277 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 TNNI2-202ENST00000381905 706 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 TNNI2-203ENST00000381906 745 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 TNNI2-204ENST00000381911 743 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 VCX3A-202ENST00000398729 808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 DMKN-256ENST00000492341 738 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 SPINT2-204ENST00000587090 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 PEBP1P2-201ENST00000603980 558 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 DUT-207ENST00000559416 635 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 ANAPC11-221ENST00000584314 559 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 TMEM126A-203ENST00000528105 656 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 AL132801.1-201ENST00000559675 567 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LAMA3Q16787 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms