Protein–RNA interactions for Protein: Q16620

NTRK2, BDNF/NT-3 growth factors receptor, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK2Q16620 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
NTRK2Q16620 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NTRK2Q16620 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NTRK2Q16620 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NTRK2Q16620 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NTRK2Q16620 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NTRK2Q16620 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NTRK2Q16620 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NTRK2Q16620 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NTRK2Q16620 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NTRK2Q16620 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NTRK2Q16620 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NTRK2Q16620 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NTRK2Q16620 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NTRK2Q16620 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NTRK2Q16620 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NTRK2Q16620 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NTRK2Q16620 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NTRK2Q16620 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NTRK2Q16620 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NTRK2Q16620 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NTRK2Q16620 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NTRK2Q16620 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NTRK2Q16620 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NTRK2Q16620 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
NTRK2Q16620 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NTRK2Q16620 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NTRK2Q16620 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NTRK2Q16620 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NTRK2Q16620 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NTRK2Q16620 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NTRK2Q16620 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NTRK2Q16620 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NTRK2Q16620 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NTRK2Q16620 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NTRK2Q16620 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
NTRK2Q16620 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NTRK2Q16620 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
NTRK2Q16620 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NTRK2Q16620 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NTRK2Q16620 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NTRK2Q16620 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NTRK2Q16620 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NTRK2Q16620 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
NTRK2Q16620 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NTRK2Q16620 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NTRK2Q16620 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NTRK2Q16620 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
NTRK2Q16620 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NTRK2Q16620 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
NTRK2Q16620 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
NTRK2Q16620 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NTRK2Q16620 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NTRK2Q16620 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NTRK2Q16620 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NTRK2Q16620 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NTRK2Q16620 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NTRK2Q16620 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NTRK2Q16620 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NTRK2Q16620 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NTRK2Q16620 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NTRK2Q16620 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NTRK2Q16620 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NTRK2Q16620 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NTRK2Q16620 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NTRK2Q16620 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NTRK2Q16620 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NTRK2Q16620 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
NTRK2Q16620 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NTRK2Q16620 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NTRK2Q16620 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NTRK2Q16620 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NTRK2Q16620 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NTRK2Q16620 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NTRK2Q16620 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NTRK2Q16620 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NTRK2Q16620 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NTRK2Q16620 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NTRK2Q16620 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NTRK2Q16620 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NTRK2Q16620 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NTRK2Q16620 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NTRK2Q16620 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NTRK2Q16620 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NTRK2Q16620 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NTRK2Q16620 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NTRK2Q16620 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NTRK2Q16620 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NTRK2Q16620 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
NTRK2Q16620 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NTRK2Q16620 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
NTRK2Q16620 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
NTRK2Q16620 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NTRK2Q16620 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NTRK2Q16620 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
NTRK2Q16620 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NTRK2Q16620 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
NTRK2Q16620 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NTRK2Q16620 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NTRK2Q16620 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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