Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC14.21□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC14.21□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
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