Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC18A3Q16572 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC18A3Q16572 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC18A3Q16572 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC18A3Q16572 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC18A3Q16572 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC18A3Q16572 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC18A3Q16572 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC18A3Q16572 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC18A3Q16572 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC18A3Q16572 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC18A3Q16572 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC18A3Q16572 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC18A3Q16572 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC18A3Q16572 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC18A3Q16572 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC18A3Q16572 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC18A3Q16572 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC18A3Q16572 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC18A3Q16572 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC18A3Q16572 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC18A3Q16572 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC18A3Q16572 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC18A3Q16572 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC18A3Q16572 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC18A3Q16572 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC18A3Q16572 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC18A3Q16572 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC18A3Q16572 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC18A3Q16572 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC18A3Q16572 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC18A3Q16572 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC18A3Q16572 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC18A3Q16572 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC18A3Q16572 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC18A3Q16572 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC18A3Q16572 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC18A3Q16572 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC18A3Q16572 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC18A3Q16572 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC18A3Q16572 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC18A3Q16572 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC18A3Q16572 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC18A3Q16572 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC18A3Q16572 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC18A3Q16572 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC18A3Q16572 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC18A3Q16572 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC18A3Q16572 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC18A3Q16572 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC18A3Q16572 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC18A3Q16572 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC18A3Q16572 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC18A3Q16572 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC18A3Q16572 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC18A3Q16572 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC18A3Q16572 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC18A3Q16572 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC18A3Q16572 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC18A3Q16572 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC18A3Q16572 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC18A3Q16572 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC18A3Q16572 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC18A3Q16572 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC18A3Q16572 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC18A3Q16572 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC18A3Q16572 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC18A3Q16572 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC18A3Q16572 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC18A3Q16572 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC18A3Q16572 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC18A3Q16572 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC18A3Q16572 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC18A3Q16572 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC18A3Q16572 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC18A3Q16572 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC18A3Q16572 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC18A3Q16572 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC18A3Q16572 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC18A3Q16572 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC18A3Q16572 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC18A3Q16572 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC18A3Q16572 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC18A3Q16572 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC18A3Q16572 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC18A3Q16572 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC18A3Q16572 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC18A3Q16572 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC18A3Q16572 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC18A3Q16572 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC18A3Q16572 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC18A3Q16572 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC18A3Q16572 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC18A3Q16572 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC18A3Q16572 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC18A3Q16572 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC18A3Q16572 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC18A3Q16572 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC18A3Q16572 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC18A3Q16572 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
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