Protein–RNA interactions for Protein: Q16549

PCSK7, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 7, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK7Q16549 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCSK7Q16549 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCSK7Q16549 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PCSK7Q16549 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCSK7Q16549 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PCSK7Q16549 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCSK7Q16549 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCSK7Q16549 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PCSK7Q16549 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCSK7Q16549 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PCSK7Q16549 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCSK7Q16549 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCSK7Q16549 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCSK7Q16549 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PCSK7Q16549 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCSK7Q16549 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCSK7Q16549 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCSK7Q16549 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCSK7Q16549 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCSK7Q16549 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCSK7Q16549 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCSK7Q16549 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCSK7Q16549 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCSK7Q16549 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCSK7Q16549 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCSK7Q16549 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCSK7Q16549 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCSK7Q16549 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCSK7Q16549 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCSK7Q16549 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCSK7Q16549 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCSK7Q16549 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCSK7Q16549 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCSK7Q16549 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCSK7Q16549 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCSK7Q16549 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
PCSK7Q16549 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PCSK7Q16549 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PCSK7Q16549 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PCSK7Q16549 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PCSK7Q16549 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCSK7Q16549 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCSK7Q16549 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCSK7Q16549 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCSK7Q16549 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCSK7Q16549 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCSK7Q16549 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCSK7Q16549 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCSK7Q16549 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCSK7Q16549 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCSK7Q16549 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PCSK7Q16549 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
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PCSK7Q16549 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCSK7Q16549 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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PCSK7Q16549 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
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PCSK7Q16549 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
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PCSK7Q16549 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCSK7Q16549 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCSK7Q16549 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCSK7Q16549 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
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PCSK7Q16549 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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PCSK7Q16549 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCSK7Q16549 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCSK7Q16549 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCSK7Q16549 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCSK7Q16549 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCSK7Q16549 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCSK7Q16549 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCSK7Q16549 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCSK7Q16549 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCSK7Q16549 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCSK7Q16549 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCSK7Q16549 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCSK7Q16549 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCSK7Q16549 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCSK7Q16549 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCSK7Q16549 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCSK7Q16549 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCSK7Q16549 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCSK7Q16549 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCSK7Q16549 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCSK7Q16549 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCSK7Q16549 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCSK7Q16549 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCSK7Q16549 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCSK7Q16549 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCSK7Q16549 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCSK7Q16549 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCSK7Q16549 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCSK7Q16549 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCSK7Q16549 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PCSK7Q16549 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCSK7Q16549 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
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