Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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GABRA6Q16445 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
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GABRA6Q16445 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
GABRA6Q16445 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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