Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 TRIO-202ENST00000344204 11100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 GLB1L3-201ENST00000389887 3566 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 PPP1R3D-201ENST00000370996 3630 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC14.26□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 RPS6KC1-206ENST00000543354 4082 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 AL356275.1-201ENST00000638446 7440 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 DPYSL2-204ENST00000521913 4805 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
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NEDD8Q15843 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
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NEDD8Q15843 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 MAP3K21-202ENST00000366623 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 GNAS-213ENST00000371099 3709 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
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