Protein–RNA interactions for Protein: Q15822

CHRNA2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA2Q15822 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CHRNA2Q15822 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CHRNA2Q15822 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CHRNA2Q15822 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CHRNA2Q15822 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CHRNA2Q15822 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CHRNA2Q15822 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CHRNA2Q15822 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CHRNA2Q15822 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CHRNA2Q15822 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CHRNA2Q15822 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CHRNA2Q15822 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CHRNA2Q15822 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CHRNA2Q15822 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CHRNA2Q15822 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CHRNA2Q15822 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CHRNA2Q15822 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CHRNA2Q15822 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CHRNA2Q15822 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CHRNA2Q15822 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CHRNA2Q15822 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CHRNA2Q15822 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CHRNA2Q15822 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
CHRNA2Q15822 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CHRNA2Q15822 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CHRNA2Q15822 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CHRNA2Q15822 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
CHRNA2Q15822 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CHRNA2Q15822 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CHRNA2Q15822 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHRNA2Q15822 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHRNA2Q15822 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHRNA2Q15822 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHRNA2Q15822 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHRNA2Q15822 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHRNA2Q15822 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHRNA2Q15822 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHRNA2Q15822 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHRNA2Q15822 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHRNA2Q15822 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHRNA2Q15822 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHRNA2Q15822 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHRNA2Q15822 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CHRNA2Q15822 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHRNA2Q15822 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHRNA2Q15822 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHRNA2Q15822 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHRNA2Q15822 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHRNA2Q15822 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CHRNA2Q15822 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHRNA2Q15822 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHRNA2Q15822 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CHRNA2Q15822 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHRNA2Q15822 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CHRNA2Q15822 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHRNA2Q15822 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHRNA2Q15822 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHRNA2Q15822 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHRNA2Q15822 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHRNA2Q15822 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHRNA2Q15822 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHRNA2Q15822 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHRNA2Q15822 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHRNA2Q15822 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHRNA2Q15822 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHRNA2Q15822 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHRNA2Q15822 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHRNA2Q15822 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHRNA2Q15822 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHRNA2Q15822 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CHRNA2Q15822 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHRNA2Q15822 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHRNA2Q15822 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHRNA2Q15822 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHRNA2Q15822 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHRNA2Q15822 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHRNA2Q15822 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHRNA2Q15822 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHRNA2Q15822 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHRNA2Q15822 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CHRNA2Q15822 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHRNA2Q15822 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHRNA2Q15822 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHRNA2Q15822 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CHRNA2Q15822 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHRNA2Q15822 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHRNA2Q15822 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHRNA2Q15822 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHRNA2Q15822 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHRNA2Q15822 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHRNA2Q15822 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHRNA2Q15822 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHRNA2Q15822 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHRNA2Q15822 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHRNA2Q15822 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHRNA2Q15822 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHRNA2Q15822 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHRNA2Q15822 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHRNA2Q15822 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHRNA2Q15822 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
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