Protein–RNA interactions for Protein: Q15560

TCEA2, Transcription elongation factor A protein 2, humanhuman

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Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA2Q15560 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TCEA2Q15560 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TCEA2Q15560 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TCEA2Q15560 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TCEA2Q15560 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TCEA2Q15560 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TCEA2Q15560 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TCEA2Q15560 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TCEA2Q15560 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TCEA2Q15560 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TCEA2Q15560 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TCEA2Q15560 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TCEA2Q15560 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TCEA2Q15560 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TCEA2Q15560 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TCEA2Q15560 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TCEA2Q15560 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TCEA2Q15560 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TCEA2Q15560 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TCEA2Q15560 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TCEA2Q15560 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TCEA2Q15560 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TCEA2Q15560 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TCEA2Q15560 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TCEA2Q15560 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TCEA2Q15560 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TCEA2Q15560 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TCEA2Q15560 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TCEA2Q15560 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TCEA2Q15560 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TCEA2Q15560 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TCEA2Q15560 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TCEA2Q15560 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TCEA2Q15560 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TCEA2Q15560 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TCEA2Q15560 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TCEA2Q15560 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TCEA2Q15560 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TCEA2Q15560 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TCEA2Q15560 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TCEA2Q15560 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TCEA2Q15560 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TCEA2Q15560 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TCEA2Q15560 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TCEA2Q15560 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TCEA2Q15560 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TCEA2Q15560 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TCEA2Q15560 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TCEA2Q15560 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TCEA2Q15560 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TCEA2Q15560 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TCEA2Q15560 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TCEA2Q15560 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TCEA2Q15560 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TCEA2Q15560 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TCEA2Q15560 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TCEA2Q15560 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TCEA2Q15560 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TCEA2Q15560 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TCEA2Q15560 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TCEA2Q15560 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TCEA2Q15560 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TCEA2Q15560 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TCEA2Q15560 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TCEA2Q15560 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TCEA2Q15560 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TCEA2Q15560 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TCEA2Q15560 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TCEA2Q15560 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TCEA2Q15560 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TCEA2Q15560 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TCEA2Q15560 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TCEA2Q15560 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TCEA2Q15560 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TCEA2Q15560 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TCEA2Q15560 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TCEA2Q15560 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TCEA2Q15560 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TCEA2Q15560 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TCEA2Q15560 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TCEA2Q15560 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TCEA2Q15560 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TCEA2Q15560 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TCEA2Q15560 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TCEA2Q15560 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TCEA2Q15560 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TCEA2Q15560 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TCEA2Q15560 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TCEA2Q15560 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TCEA2Q15560 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TCEA2Q15560 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TCEA2Q15560 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TCEA2Q15560 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TCEA2Q15560 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TCEA2Q15560 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TCEA2Q15560 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TCEA2Q15560 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TCEA2Q15560 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TCEA2Q15560 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TCEA2Q15560 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
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