Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SS18Q15532 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SS18Q15532 ANTXR2-203ENST00000403729 8273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SS18Q15532 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SS18Q15532 CELSR1-201ENST00000262738 11389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SS18Q15532 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SS18Q15532 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SS18Q15532 CACNA1G-232ENST00000515411 6960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SS18Q15532 CACNA1G-233ENST00000515765 6981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SS18Q15532 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SS18Q15532 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SS18Q15532 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SS18Q15532 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SS18Q15532 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SS18Q15532 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SS18Q15532 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SS18Q15532 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SS18Q15532 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SS18Q15532 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
SS18Q15532 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SS18Q15532 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SS18Q15532 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SS18Q15532 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SS18Q15532 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SS18Q15532 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SS18Q15532 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SS18Q15532 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
SS18Q15532 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
SS18Q15532 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
SS18Q15532 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SS18Q15532 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SS18Q15532 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SS18Q15532 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
SS18Q15532 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
SS18Q15532 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
SS18Q15532 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SS18Q15532 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
SS18Q15532 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
SS18Q15532 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SS18Q15532 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SS18Q15532 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SS18Q15532 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SS18Q15532 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SS18Q15532 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SS18Q15532 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SS18Q15532 NAA15-201ENST00000296543 6222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SS18Q15532 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SS18Q15532 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SS18Q15532 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SS18Q15532 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SS18Q15532 FANCC-201ENST00000289081 4585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SS18Q15532 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SS18Q15532 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SS18Q15532 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SS18Q15532 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SS18Q15532 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
SS18Q15532 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SS18Q15532 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SS18Q15532 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SS18Q15532 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SS18Q15532 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SS18Q15532 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SS18Q15532 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SS18Q15532 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SS18Q15532 MROH2A-208ENST00000610772 5324 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SS18Q15532 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SS18Q15532 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SS18Q15532 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SS18Q15532 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SS18Q15532 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SS18Q15532 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SS18Q15532 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SS18Q15532 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SS18Q15532 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SS18Q15532 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SS18Q15532 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SS18Q15532 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SS18Q15532 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
SS18Q15532 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SS18Q15532 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
SS18Q15532 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SS18Q15532 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SS18Q15532 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SS18Q15532 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SS18Q15532 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
SS18Q15532 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SS18Q15532 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SS18Q15532 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SS18Q15532 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SS18Q15532 NCOR2-201ENST00000356219 7226 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SS18Q15532 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SS18Q15532 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SS18Q15532 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SS18Q15532 ROBO1-201ENST00000436010 7501 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SS18Q15532 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SS18Q15532 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SS18Q15532 DSE-201ENST00000331677 7237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SS18Q15532 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SS18Q15532 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SS18Q15532 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms