Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SYCP1Q15431 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SYCP1Q15431 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SYCP1Q15431 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SYCP1Q15431 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SYCP1Q15431 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SYCP1Q15431 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SYCP1Q15431 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SYCP1Q15431 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SYCP1Q15431 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SYCP1Q15431 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SYCP1Q15431 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SYCP1Q15431 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SYCP1Q15431 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SYCP1Q15431 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SYCP1Q15431 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SYCP1Q15431 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SYCP1Q15431 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SYCP1Q15431 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SYCP1Q15431 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SYCP1Q15431 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SYCP1Q15431 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SYCP1Q15431 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SYCP1Q15431 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SYCP1Q15431 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SYCP1Q15431 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SYCP1Q15431 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SYCP1Q15431 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SYCP1Q15431 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SYCP1Q15431 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SYCP1Q15431 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SYCP1Q15431 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SYCP1Q15431 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SYCP1Q15431 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SYCP1Q15431 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SYCP1Q15431 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SYCP1Q15431 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SYCP1Q15431 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SYCP1Q15431 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SYCP1Q15431 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SYCP1Q15431 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SYCP1Q15431 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SYCP1Q15431 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SYCP1Q15431 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SYCP1Q15431 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SYCP1Q15431 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SYCP1Q15431 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SYCP1Q15431 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SYCP1Q15431 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SYCP1Q15431 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SYCP1Q15431 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SYCP1Q15431 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SYCP1Q15431 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SYCP1Q15431 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SYCP1Q15431 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SYCP1Q15431 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SYCP1Q15431 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SYCP1Q15431 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SYCP1Q15431 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SYCP1Q15431 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SYCP1Q15431 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SYCP1Q15431 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SYCP1Q15431 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SYCP1Q15431 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SYCP1Q15431 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SYCP1Q15431 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SYCP1Q15431 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SYCP1Q15431 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SYCP1Q15431 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SYCP1Q15431 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SYCP1Q15431 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SYCP1Q15431 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SYCP1Q15431 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SYCP1Q15431 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
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SYCP1Q15431 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SYCP1Q15431 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SYCP1Q15431 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SYCP1Q15431 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SYCP1Q15431 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SYCP1Q15431 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SYCP1Q15431 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SYCP1Q15431 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
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SYCP1Q15431 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SYCP1Q15431 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SYCP1Q15431 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SYCP1Q15431 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
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SYCP1Q15431 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SYCP1Q15431 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SYCP1Q15431 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SYCP1Q15431 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SYCP1Q15431 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SYCP1Q15431 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SYCP1Q15431 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SYCP1Q15431 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SYCP1Q15431 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
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