Protein–RNA interactions for Protein: Q14761

PTPRCAP, Protein tyrosine phosphatase receptor type C-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAPQ14761 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRCAPQ14761 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRCAPQ14761 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRCAPQ14761 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRCAPQ14761 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRCAPQ14761 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRCAPQ14761 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRCAPQ14761 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRCAPQ14761 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRCAPQ14761 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRCAPQ14761 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRCAPQ14761 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRCAPQ14761 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRCAPQ14761 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRCAPQ14761 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRCAPQ14761 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRCAPQ14761 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRCAPQ14761 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRCAPQ14761 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRCAPQ14761 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRCAPQ14761 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRCAPQ14761 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRCAPQ14761 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRCAPQ14761 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRCAPQ14761 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRCAPQ14761 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRCAPQ14761 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRCAPQ14761 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRCAPQ14761 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRCAPQ14761 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRCAPQ14761 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRCAPQ14761 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRCAPQ14761 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRCAPQ14761 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRCAPQ14761 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRCAPQ14761 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRCAPQ14761 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRCAPQ14761 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRCAPQ14761 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRCAPQ14761 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRCAPQ14761 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRCAPQ14761 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRCAPQ14761 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRCAPQ14761 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRCAPQ14761 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRCAPQ14761 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRCAPQ14761 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRCAPQ14761 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRCAPQ14761 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRCAPQ14761 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRCAPQ14761 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRCAPQ14761 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRCAPQ14761 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRCAPQ14761 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRCAPQ14761 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRCAPQ14761 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRCAPQ14761 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRCAPQ14761 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRCAPQ14761 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRCAPQ14761 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRCAPQ14761 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRCAPQ14761 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRCAPQ14761 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRCAPQ14761 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRCAPQ14761 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRCAPQ14761 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRCAPQ14761 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRCAPQ14761 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRCAPQ14761 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRCAPQ14761 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRCAPQ14761 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRCAPQ14761 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRCAPQ14761 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRCAPQ14761 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRCAPQ14761 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRCAPQ14761 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRCAPQ14761 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRCAPQ14761 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRCAPQ14761 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRCAPQ14761 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRCAPQ14761 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRCAPQ14761 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRCAPQ14761 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRCAPQ14761 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRCAPQ14761 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRCAPQ14761 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRCAPQ14761 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRCAPQ14761 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTPRCAPQ14761 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTPRCAPQ14761 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTPRCAPQ14761 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTPRCAPQ14761 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTPRCAPQ14761 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PTPRCAPQ14761 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTPRCAPQ14761 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTPRCAPQ14761 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PTPRCAPQ14761 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTPRCAPQ14761 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTPRCAPQ14761 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTPRCAPQ14761 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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