Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CNGB1Q14028 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CNGB1Q14028 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CNGB1Q14028 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CNGB1Q14028 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CNGB1Q14028 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CNGB1Q14028 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CNGB1Q14028 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CNGB1Q14028 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CNGB1Q14028 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CNGB1Q14028 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CNGB1Q14028 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CNGB1Q14028 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CNGB1Q14028 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CNGB1Q14028 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CNGB1Q14028 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CNGB1Q14028 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CNGB1Q14028 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CNGB1Q14028 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
CNGB1Q14028 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CNGB1Q14028 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CNGB1Q14028 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CNGB1Q14028 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CNGB1Q14028 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CNGB1Q14028 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CNGB1Q14028 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CNGB1Q14028 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CNGB1Q14028 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CNGB1Q14028 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CNGB1Q14028 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CNGB1Q14028 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CNGB1Q14028 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CNGB1Q14028 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CNGB1Q14028 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CNGB1Q14028 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CNGB1Q14028 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNGB1Q14028 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNGB1Q14028 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNGB1Q14028 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNGB1Q14028 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNGB1Q14028 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNGB1Q14028 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNGB1Q14028 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNGB1Q14028 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNGB1Q14028 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNGB1Q14028 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNGB1Q14028 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNGB1Q14028 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNGB1Q14028 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNGB1Q14028 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CNGB1Q14028 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNGB1Q14028 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNGB1Q14028 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNGB1Q14028 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNGB1Q14028 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNGB1Q14028 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNGB1Q14028 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNGB1Q14028 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNGB1Q14028 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNGB1Q14028 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNGB1Q14028 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CNGB1Q14028 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNGB1Q14028 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNGB1Q14028 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNGB1Q14028 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNGB1Q14028 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNGB1Q14028 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNGB1Q14028 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNGB1Q14028 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNGB1Q14028 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNGB1Q14028 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNGB1Q14028 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNGB1Q14028 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNGB1Q14028 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNGB1Q14028 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNGB1Q14028 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNGB1Q14028 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNGB1Q14028 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNGB1Q14028 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNGB1Q14028 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNGB1Q14028 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNGB1Q14028 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNGB1Q14028 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CNGB1Q14028 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CNGB1Q14028 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNGB1Q14028 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNGB1Q14028 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CNGB1Q14028 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CNGB1Q14028 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CNGB1Q14028 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CNGB1Q14028 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNGB1Q14028 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNGB1Q14028 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNGB1Q14028 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNGB1Q14028 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNGB1Q14028 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNGB1Q14028 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNGB1Q14028 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNGB1Q14028 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNGB1Q14028 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
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