Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DDX39BQ13838 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DDX39BQ13838 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DDX39BQ13838 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DDX39BQ13838 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DDX39BQ13838 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DDX39BQ13838 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
DDX39BQ13838 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DDX39BQ13838 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DDX39BQ13838 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DDX39BQ13838 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DDX39BQ13838 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DDX39BQ13838 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DDX39BQ13838 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DDX39BQ13838 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DDX39BQ13838 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DDX39BQ13838 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DDX39BQ13838 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DDX39BQ13838 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DDX39BQ13838 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DDX39BQ13838 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DDX39BQ13838 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DDX39BQ13838 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DDX39BQ13838 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DDX39BQ13838 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DDX39BQ13838 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DDX39BQ13838 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DDX39BQ13838 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DDX39BQ13838 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DDX39BQ13838 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DDX39BQ13838 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DDX39BQ13838 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DDX39BQ13838 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DDX39BQ13838 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DDX39BQ13838 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DDX39BQ13838 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DDX39BQ13838 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DDX39BQ13838 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DDX39BQ13838 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
DDX39BQ13838 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DDX39BQ13838 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DDX39BQ13838 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DDX39BQ13838 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DDX39BQ13838 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DDX39BQ13838 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DDX39BQ13838 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DDX39BQ13838 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DDX39BQ13838 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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DDX39BQ13838 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DDX39BQ13838 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DDX39BQ13838 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DDX39BQ13838 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DDX39BQ13838 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DDX39BQ13838 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DDX39BQ13838 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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DDX39BQ13838 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DDX39BQ13838 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DDX39BQ13838 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DDX39BQ13838 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DDX39BQ13838 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DDX39BQ13838 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DDX39BQ13838 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DDX39BQ13838 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DDX39BQ13838 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DDX39BQ13838 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DDX39BQ13838 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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DDX39BQ13838 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DDX39BQ13838 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DDX39BQ13838 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DDX39BQ13838 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DDX39BQ13838 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DDX39BQ13838 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
DDX39BQ13838 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DDX39BQ13838 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DDX39BQ13838 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
DDX39BQ13838 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DDX39BQ13838 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DDX39BQ13838 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DDX39BQ13838 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DDX39BQ13838 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DDX39BQ13838 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
DDX39BQ13838 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
DDX39BQ13838 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DDX39BQ13838 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DDX39BQ13838 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DDX39BQ13838 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DDX39BQ13838 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DDX39BQ13838 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DDX39BQ13838 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DDX39BQ13838 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
DDX39BQ13838 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DDX39BQ13838 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DDX39BQ13838 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DDX39BQ13838 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DDX39BQ13838 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DDX39BQ13838 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DDX39BQ13838 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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