Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SHROOM2Q13796 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SHROOM2Q13796 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SHROOM2Q13796 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SHROOM2Q13796 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SHROOM2Q13796 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SHROOM2Q13796 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SHROOM2Q13796 AQP7P5-201ENST00000428759 1049 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SHROOM2Q13796 AQP7P4-201ENST00000447083 1042 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SHROOM2Q13796 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SHROOM2Q13796 AQP7P2-201ENST00000453967 1041 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SHROOM2Q13796 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SHROOM2Q13796 AC106047.2-201ENST00000511723 743 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SHROOM2Q13796 ZNF879-202ENST00000519896 543 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SHROOM2Q13796 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SHROOM2Q13796 AQP7P3-201ENST00000624547 1041 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SHROOM2Q13796 AC002044.2-201ENST00000624910 970 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SHROOM2Q13796 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SHROOM2Q13796 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SHROOM2Q13796 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SHROOM2Q13796 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SHROOM2Q13796 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SHROOM2Q13796 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SHROOM2Q13796 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SHROOM2Q13796 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SHROOM2Q13796 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SHROOM2Q13796 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SHROOM2Q13796 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SHROOM2Q13796 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SHROOM2Q13796 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SHROOM2Q13796 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SHROOM2Q13796 HTATIP2-205ENST00000530266 713 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SHROOM2Q13796 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SHROOM2Q13796 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SHROOM2Q13796 TGFB3-204ENST00000556285 1280 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SHROOM2Q13796 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SHROOM2Q13796 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.39
SHROOM2Q13796 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.39
SHROOM2Q13796 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SHROOM2Q13796 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SHROOM2Q13796 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SHROOM2Q13796 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SHROOM2Q13796 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SHROOM2Q13796 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SHROOM2Q13796 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SHROOM2Q13796 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SHROOM2Q13796 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SHROOM2Q13796 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SHROOM2Q13796 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SHROOM2Q13796 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SHROOM2Q13796 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SHROOM2Q13796 SFT2D2-202ENST00000367829 491 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SHROOM2Q13796 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SHROOM2Q13796 DARS-AS1-204ENST00000444406 442 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SHROOM2Q13796 AL135901.1-201ENST00000451812 333 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SHROOM2Q13796 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SHROOM2Q13796 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SHROOM2Q13796 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SHROOM2Q13796 AL451007.2-201ENST00000632004 563 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SHROOM2Q13796 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SHROOM2Q13796 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SHROOM2Q13796 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SHROOM2Q13796 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SHROOM2Q13796 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SHROOM2Q13796 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SHROOM2Q13796 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SHROOM2Q13796 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SHROOM2Q13796 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SHROOM2Q13796 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SHROOM2Q13796 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SHROOM2Q13796 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SHROOM2Q13796 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SHROOM2Q13796 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SHROOM2Q13796 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SHROOM2Q13796 CRYBB3-201ENST00000215855 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SHROOM2Q13796 HIST1H1D-201ENST00000244534 666 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SHROOM2Q13796 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SHROOM2Q13796 RAD51C-203ENST00000421782 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SHROOM2Q13796 FAM92A-202ENST00000423990 914 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SHROOM2Q13796 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SHROOM2Q13796 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SHROOM2Q13796 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SHROOM2Q13796 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SHROOM2Q13796 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SHROOM2Q13796 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SHROOM2Q13796 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SHROOM2Q13796 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SHROOM2Q13796 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SHROOM2Q13796 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SHROOM2Q13796 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SHROOM2Q13796 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SHROOM2Q13796 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SHROOM2Q13796 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SHROOM2Q13796 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SHROOM2Q13796 LY86-202ENST00000379953 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SHROOM2Q13796 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SHROOM2Q13796 PLAC9P1-201ENST00000397540 389 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SHROOM2Q13796 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SHROOM2Q13796 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SHROOM2Q13796 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms